靶蛋白降解后的表型是什么?
What Is the Phenotypic Consequence of Target Degradation?
与基因敲除或蛋白突变相比,细胞内蛋白质的短暂降解通常会引起一种完全不同的表型。HaloPROTAC-3是HaloTag®标签与PROTAC的融合小分子,是了解和表征蛋白质降解表型的一种快速高效的方法。 HaloPROTAC-3将内源性VHL E3连接酶组分引入HaloTag®融合蛋白,通过蛋白酶体途径实现泛素化降解。HaloPROTAC包含一个诱导降解的酰胺部分,通过可变长度的连接物与氯化烷烃结合。 为了研究相关细胞背景下的内源性蛋白减少,我们建议通过CRISPR/Cas9基因编辑技术将HaloTag®或HiBiT-HaloTag®标签整合到靶标蛋白位点。使用HaloTag®单克隆抗体(用于HaloTag®标签)或活细胞发光法(使用HiBiT-HaloTag®标签) 监测HaloPROTAC-3处理的细胞中蛋白质的减少情况。HaloPROTAC-3显示了内源性标记的HaloTag®融合蛋白随着时间的推移而持续的快速降低。 | |
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上图. HaloPROTAC-3结构图。分子中诱导降解的酰胺部分通过灵活的三醚连接物偶联到氯化烷烃部分。 | | 上图. HiBiT-BRD4降解机制。内源性标记HiBiT和HaloTag®标签的BRD4,通过HaloPROTAC浓度的增加发生降解,并使用HiBiT发光检测进行定量。 |
上图.HaloPROTAC3 在不同细胞区降解 HiBiT-HaloTag CRISPR 靶标。结果表明,HaloPROTAC3 能快速、突发性地降解多个细胞区系中的靶标,包括单通道线粒体膜蛋白。这证实了蛋白质可以通过蛋白酶体降解策略靶向。